Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270894
Help
Entry
DDB_G0270894 CDS
T00245
Symbol
irlC
Name
(RefSeq) IRE family protein kinase
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
Ribonuc_2-5A
Pkinase_fungal
RIO1
TCAD9
Kdo
SR-25
DUF3439
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617083
NCBI-ProteinID:
XP_646133
dictyBase:
DDB_G0270894
UniProt:
Q55DJ8
LinkDB
All DBs
Position
1:3195968..3200425
Genome browser
AA seq
1444 aa
AA seq
DB search
MKSNYSTYLYKMSELERIVNGGDVSSIFIEQDDVLGEIKNFNYDLYTKYDSLVLKDPQTQ
NNSPKPPSLEIFILVNLIALCGRINDKFPNLDKFLTHYKYATNIFNLLSENIINSIEKFK
ETLSKDLPSFQLSVIANSSIVKKDNSIIKFLSCFGSFMKLESIEYFGSVFNSLIGEEDQF
SLDLLQVLIDSSNEYKKFLQILEFNQLQKYYDDGHLCLFHSIKFDNLNEFKLLFNDSTWC
QQQQQQQQINPQIFWFILCKYNSSKIAHYLLNDYQINKKSLKQKNPLEISPVTLLEIAFL
CFSDKIAIVLFSQFNYHELLPKKSKMKHLIKSTSTLINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNSKNIGLTQYTVLEGYFLINIRTRSRIAPFIEVLTMNGIHLTNDIIHTRIKSM
SSDSIFRIFTEQYQQQQQNPLNNNQKQIQFNENFTRQQKIDFDNCPNEIDTFILDKTQCN
LITLSQEFSIKVRAFTFYLSFGEIFTCSCEDYKREFSCKHMFFILLNYYHVPRNSYLIYQ
RQFTEIERYSIIMNIDLSKINSRIYGTPNFNTFFKIKSSPSSTTSPFQSINNNNNNNLNN
NNNNNLNNNNNNENENKFKEDGDDEILQNLNRLNYILLRDFEFGPNDITTKLRETHINLF
DRLLLIEDNLEALDKILKNFTQKGCTLSRDLVGDRNLLVLVAILDSTSKEKLSLLNKYWP
LPEKTKKFAIPLIFFAISEECLKMFIQISPNLVKSTLNLHDWISILTEFALINETFLDHY
PLLSAWYSDARSVETSLFRLFTCMDKIDCINYLIQTYLLPIPTFKNTLNNFETCYFFETY
FLENSSIKAEQYLLEQELLEKKKQKEKKKQKQKQSKSKIINNPLSSSSSSSSSPSTSNTT
ITSTTPTTTTTTTTTTTPTTTTTTTTTSSPKQKPITPIKKEIEKEFEKIELTTPPPPLAT
TKQQQINENYDISIGKFKFNRKEENVLGRGSNGTLVFKGIWNNRIPVAIKQMQKMFNPLI
SKEIEVLITLTNKNCYNIVRYIDQEEDESCVYLGLTLCDGSLQNLVEKGDNNLTLTQFLG
YDINSSSKNNSRLLELIKDIVYGIQFLHQQGIVHNDLNPRNILIKDDRFIISDLGLSKME
VTSSYSFTMHAPTGQEGFHPAEVLLEKRKTKSVDIFSMGCILFYLMTGGQHPFGDKFYRI
VNILTDKPILEPLKHNLVACDLISQMISKNESDRPTIEKILLHPFFWNHEKKVKFIDASL
NLFKDSNGLFTSKLNKLINYQEINLKNNIDSSSSNNNNNINSNVINNNNNNNNGMATNIP
FLSKPWNQLIDQTLIEHIINKQNQLNGVGNNKKVIIYSFDQVKDLVRCIRNTIQHHKEIQ
RLVRQSPSSNGDNKQEVLDCLESQELVLSYFEEKVPDLLLFLYQKFKKHLDSKSLIYFND
LIIK
NT seq
4335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaattacagtacatatctttataaaatgtcagaattagaaaggatagtgaat
ggtggtgacgtttcaagtattttcattgaacaagatgatgtattaggtgaaattaaaaac
tttaactatgatttatatacaaaatatgattcattagttttaaaagatcctcaaactcaa
aataattcaccaaaaccaccaagcctagaaatatttatactagttaatttaatagcgtta
tgtggtagaattaatgataaatttccaaatttagataaatttttaactcattataaatat
gctactaatatatttaacttattaagtgaaaatattataaattctattgaaaaatttaaa
gaaacattatcaaaagatttaccaagttttcaattatcagttatagcgaatagttcaatt
gtaaaaaaagataattcaattataaagtttttaagttgttttggatcatttatgaaatta
gaatcaattgaatattttggatcagtatttaatagtttaataggagaagaggaccaattc
tcattagatttattacaagttttaattgatagttcaaatgaatataaaaagtttttacaa
attttagaatttaatcaattacaaaaatattatgatgatggtcatctttgtttatttcat
tcaattaaatttgataatttaaatgaatttaaattattatttaatgattctacttggtgt
caacagcaacagcagcaacaacaaataaatcctcaaatattttggtttatactttgtaaa
tataattcatcaaaaattgcccattatcttttaaatgattatcaaattaataaaaaatca
ttaaaacaaaagaatccattagaaattagtcctgtaactctattagaaatcgctttctta
tgttttagtgataaaattgcaattgtattattttcacaatttaattatcatgaattatta
ccaaagaaatcaaaaatgaaacatttaattaaatcaacttcaactttaataaataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataatagtaaaaatatcggattaacacaatatacagtttta
gaaggttattttttaattaatattagaacaaggagtaggatagcaccatttatcgaagtt
ttaacaatgaatggtatccatttaacaaatgatataatacatactagaattaaatcaatg
agttctgattcaatatttagaatatttacagaacaataccaacaacaacaacagaatcca
ctaaataataatcaaaaacaaattcaatttaatgaaaatttcacaagacaacaaaaaata
gatttcgataattgtccaaatgaaattgatacttttattttagataaaactcaatgtaat
ttaataacattatctcaagagttttcaatcaaagttagagcattcacattttatttgtca
tttggtgaaatattcacttgttcttgtgaagactataaaagagaattctcttgtaaacat
atgtttttcattcttttaaattattatcatgttccaagaaattcctatctaatctatcaa
agacaatttacagagattgaaagatattcaataattatgaatatagatttaagtaaaatt
aattcaagaatatatggtactccaaattttaatactttttttaaaattaaatcatcacca
tcatcaacaacatcaccatttcaaagtattaataataacaataataataatttaaacaat
aataataataataatttaaataataataataataatgaaaatgaaaataaatttaaagaa
gatggtgatgatgaaattttacaaaatttaaatagattaaattatatattattaagggat
tttgaatttggaccaaatgatattacaactaaacttcgagaaactcatataaatctattt
gatagattattacttatagaggataatttagaggcattggataagatattaaagaatttc
actcaaaaaggttgtacattatcaagggatttggttggtgatcgtaatctattggtttta
gtggcaattctagattcaacttcaaaagagaaactatcattattgaacaagtattggcca
ttacctgaaaaaacgaaaaagtttgctattccattaattttctttgcaatatctgaagaa
tgtttaaaaatgtttattcaaatctctccaaatttagttaaatcaactttaaacttacat
gattggatttcaattctaactgaattcgccttaattaatgaaactttcttagaccattac
ccacttttatccgcttggtatagtgatgctcgttcagttgaaacctcattatttagatta
ttcacctgtatggataaaatagattgtataaattacttaattcaaacctatcttttacca
attccaactttcaaaaatactctaaataattttgaaacttgttacttttttgaaacttat
ttccttgaaaactcctcaatcaaagctgaacaatacttattagaacaggaactattagaa
aaaaaaaaacaaaaagaaaaaaaaaaacaaaaacaaaaacaatcaaaatcaaaaattatt
aataatcctttatcatcatcatcatcatcatcatcatcaccatcaacttctaatactaca
atcacctcaacaacaccaacaacaacaacaaccaccaccacaacaacaacaccaacaact
acaacaacaacaacaacaacatcatcaccaaaacaaaaacctataactccaattaaaaaa
gaaatagaaaaagaatttgaaaaaattgaacttactacaccaccaccaccattggcaaca
accaaacaacaacaaattaatgaaaattatgatatttcaattggtaaatttaaatttaat
agaaaagaagagaatgtattaggtagaggatcaaatggtacattagtttttaaaggtatt
tggaataatagaattccagttgcaattaaacaaatgcaaaagatgtttaatccattaatt
agtaaagagattgaagtattaattacattaacaaataagaattgttataacattgtaaga
tatattgatcaagaagaagatgaatcatgcgtttatttaggtttaacactatgtgatggt
tctttgcaaaatttagttgaaaaaggtgataataacctgacattaactcaatttttaggc
tatgatattaatagcagtagtaaaaataattcaagattattagaactaattaaagatatt
gtttatggtattcaatttttacatcaacaaggtatagttcataatgatttaaatccaagg
aatattttaattaaagatgatagattcattatatcggatttagggctaagtaaaatggaa
gtaacttcatcatactcatttacgatgcatgctccaactggtcaagaaggttttcatccg
gctgaagtactattagagaaacgtaaaactaaatctgttgatatcttttcaatgggttgt
attctattttatttaatgactggtggtcaacatccatttggtgataaattctatcgtatt
gttaatattttaacagataaaccaatcctcgaaccattgaaacataatttagtagcatgt
gatttaattagtcaaatgatatcaaaaaatgaatctgatagaccaacaattgaaaaaata
cttttacatccattcttttggaatcatgaaaagaaagttaaattcattgatgcttcttta
aatttatttaaagattcaaatggtttattcacttcaaaattaaataaattaattaattat
caagaaattaatttaaaaaataatattgatagtagtagtagtaataataataataatata
aatagtaatgtaattaataataataataataataataatggtatggcgactaatatacca
tttttatcaaaaccatggaaccaattaattgatcaaactttaattgaacatataataaat
aaacaaaatcaattaaatggtgtcggtaataataaaaaggtaataatttacagttttgat
caagtaaaagatttagtacgttgtattagaaatacaatacaacatcataaagagattcaa
agattagttagacaatcaccatcatcaaatggtgataataaacaagaagttttggattgt
ttagagagtcaagaattagttttatcttattttgaagaaaaagttcccgaccttttactc
tttctttatcaaaagtttaaaaaacatttggattcaaaatccttaatttattttaatgat
ttaataattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
